當前設施條件下的瓜果蔬菜生產，存在著重茬連作障礙問題，連作障礙常表現為農作物產量降低，品質變劣，生長受限甚至植株死亡，造成嚴重的經濟損失。其原因有一下幾個方面：其一，土壤病害的積累滋生，使得土壤微生物環境惡化，導致一些土傳病害如枯病，猝倒病的嚴重發生；其二，大棚內缺乏外界雨水的滋潤，造成土質的鹽堿化；其三，因植物的選擇吸收而導致某些礦物質微量元素的缺乏。當然，還有許多復雜的綜合因素也會發生連作障礙，如一些專一化病害病原基數的增加，導致重茬易得病；也有因肥水管理不科學造成土壤肥力降低，礦質元素無效化，土壤結構板結等問題 ，導致重茬障礙。目前，生產上克服連作障礙的方法有輪作，抗性砧連作障礙控制方法。目前，常用的土壤熏蒸殺菌劑包括溴甲烷，棉隆，威百畝，氯化苦等，但是這些熏蒸劑大都污染環境且對人體有害。

一般土壤細菌數量越多，真菌數量越少，細菌與真菌的比值越高，就越有利于作物生長。研究發現，澆灌為酸性電解水顯著降低了蘋果連作土壤中真菌和細菌數量，真菌降低幅度大于細菌。因此，澆灌微酸性電解水使蘋果連作土壤中細菌與真菌的比值增加。這可能是因為連作土壤中澆入微酸性次氯酸水后真菌繁殖的程度小于細菌繁殖的程度，導致連作土壤向細菌化發展，有利于土壤的良性發育。使用微酸性次氯酸水處理連作土壤后，土壤具有更高的豐富指數，多樣性指數，均勻度指數和更低的優勢度指數，且微酸性電解水處理后明顯改變了連作土壤中的真菌群落結構